Ян Вагнер народився 1971 року в Гамбурзі. Вивчав Англістику та Американські студії спочатку в університеті Гамбурга, пізніше у Дубліні, допоки 1995 року не переїхав до Берліну, де живе до сьогодні. Там він присвятив себе спочатку виданню «Die Aussenseite des Elementes» «Внутрішня сторона елементу», яке двічі на рік видавав з 1995 року спільно з Томасом Гірстом.
З 2001 року, коли вийшла у світ його перша збірка віршів «Probebohrung im Himmel» «Пробне свердління у небі», Ян Вагнер є вільним поетом, перекладачем та літературним критиком. Співпрацює з різними газетами, виданнями.
Як видавець опублікував у 2003 році антологію «Lyrik von Jetzt. 74 Stimmen» «Лірика сьогодення. 74 голоси» спільно з Бйорном Кулігком. Антологія включає в себе збірку молодої німецькомовної поезії. Його вірші перекладені багатьма мовами світу.
